一、操作界面结构概述

赛默飞3500的控制界面基于Applied Biosystems的3500 Data Collection Software平台，具备多用户支持、角色权限划分和审计日志等特性。其整体界面结构主要包括五大模块：

1. 仪器状态面板（Instrument Status）

2. 运行配置面板（Run Scheduler）

3. 实验设置模块（Run Setup）

4. 样本管理与板图编辑（Plate Manager）

5. 系统管理与设置（Admin Settings）

界面设计遵循任务导向原则，使操作者可以通过点击式交互快速完成样本加载、实验参数配置、序列检测启动等步骤。

二、仪器状态面板详解

仪器状态面板用于实时监控设备硬件的运行情况，包括温控状态、电泳模块、激光器、CCD检测系统以及缓冲液和耗材状态。此界面通过颜色与图标提示：

• 绿色：表示模块正常工作

• 黄色：提示维护预警或参数偏离正常范围

• 红色：表明存在设备故障或关键错误

此外，仪器状态面板还集成了实时传感器数据，如温度、电压、电流等，用于判断系统是否处于适配分析的稳定运行状态。

三、运行配置面板功能说明

运行配置面板（Run Scheduler）负责管理和调度分析任务。用户可通过此模块：

• 创建新的运行任务队列

• 调整已有运行的优先级与顺序

• 查看历史运行记录及其分析日志

• 设置计划任务执行时间与间隔

界面支持直观的拖放操作，可实现批量样本的自动调度，尤其适用于高通量的检测需求。

四、实验设置模块配置指南

实验设置模块（Run Setup）是操作界面的核心功能区域。用户在此配置具体的实验参数，包括但不限于：

4.1 模板选择（Template Selection）

系统内置多种实验模板，如：

• Fragment Analysis

• Sanger Sequencing

• Microsatellite Analysis

• SNP Genotyping

用户可基于模板快速设定适配参数，并支持自定义保存常用实验流程。

4.2 电泳参数设定

包括以下核心选项：

• Injection Voltage：样本注入电压（一般为1.2~1.6kV）

• Injection Time：注入时间（常设5~15s）

• Run Voltage：电泳运行电压（一般设置在13~15kV）

• Run Temperature：通常设为60°C，保证聚合物粘度稳定

用户可基于实验目的精细调整每一项参数，系统支持实时预估运行时间。

4.3 激发与检测通道设置

赛默飞3500支持多个激发激光与检测通道，常用染料组合如：G5、POP7、DS-30等。界面提供通道配置面板，用于选择：

• 通道染料名称

• 光谱重叠补偿矩阵

• 检测灵敏度与阈值调整

此配置直接影响分析精度与多重检测能力。

五、样本管理与板图编辑模块

该模块用于样本ID、反应板信息与检测通道的关联配置。功能包括：

• 板图创建（Plate Editor）：支持96孔或384孔板编辑，分配每孔样本类型、实验目的（如SEQ/Fragment）

• 样本输入：支持导入Excel格式批量信息，样本命名可自动递增

• 反应体系标注：用户可为不同反应组指定分析模板，确保自动化兼容性

板图配置可与运行配置模块联动，实现“模板+样本+参数”的一体化定义。

六、系统设置与用户管理模块

此模块主要涉及系统初始化与权限控制，适用于实验室管理者与管理员操作。核心内容包括：

6.1 用户角色与权限配置

系统支持自定义用户角色，包括：

• 管理员（具有全部权限）

• 高级用户（可创建与编辑任务）

• 普通用户（仅可执行任务）

每位用户的操作均会被记录在审计日志中，支持追踪与合规管理。

6.2 网络与文件路径设置

可配置分析文件的默认保存路径、FTP传输设置、LIMS对接接口等，便于与实验室信息管理系统集成。

6.3 耗材监控与维护预警

用户可设置：

• 缓冲液余量阈值

• 聚合物更换周期提醒

• 电泳模块维护周期

界面提供直观的耗材监控面板，并可与邮件通知系统联动。

七、配置流程实例演示

以下是一次标准操作流程的界面配置步骤：

1. 初始化仪器状态检查

• 查看温度、电压、激光状态，确保无故障报警

2. 导入样本板图

• 使用Excel模板导入样本信息，配置样本位置

3. 选择实验模板

• 如进行STR分析，则选择“Fragment Analysis”模板

4. 设定运行参数

• 注入电压：1.5kV，注入时间：10s，运行电压：15kV，运行温度：60°C

5. 配置染料与检测通道

• 选择G5染料组合，确认检测通道顺序和光谱重叠补偿参数

6. 调度运行任务

• 设定自动运行时间或手动点击“Start Run”

7. 数据输出设置

• 指定分析结果保存位置，设定自动导出格式（.fsa/.ab1）

八、常见问题与优化建议

8.1 问题：样本信号强度偏低

• 检查注入时间与电压设置

• 确保毛细管未污染且聚合物无气泡

• 使用染料校准功能确保激发通道准确

8.2 问题：通道间干扰信号重叠

• 重新配置光谱分离矩阵

• 检查染料标记是否匹配实验模板要求

8.3 优化建议

• 合理设置样本运行批次，避免连续高强度运行引发毛细管过热

• 定期更新系统软件补丁，提升兼容性与稳定性

• 使用预设模板减少人为配置错误

九、总结

赛默飞3500遗传分析仪的操作界面配置以高度自动化、模块清晰、可视化交互为核心特征，为用户提供了完整的实验控制与数据管理平台。通过科学配置运行参数、优化样本信息录入和合理调度实验任务，操作者可大幅提升实验效率与数据质量。熟练掌握界面配置方法是实现3500系统高性能运行的关键环节，也是保障分析准确性与实验安全性的基础。

如需进一步深入优化，可结合LabLink/LIMS系统实现操作流程的标准化与数据的集中管理，为大规模基因分析提供强有力的支撑。