检查仪器外壳有无破损,内部部件是否安装牢固;
确认毛细管阵列已正确安装,无翘曲、折断、连接松动;
检查电源接口、数据线连接是否稳固,配件是否齐全(聚合物袋、缓冲瓶、样本盘等);
仪器内部温控模块、激光系统、电源模块需无异常提示。
启动Data Collection软件,检查界面是否能识别毛细管阵列编号;
检查软件是否能正确识别温度、电压、毛细管状态等;
测试样本板加载与弹出动作是否灵敏;
检查样本板扫描功能是否准确定位孔位;
确认各项运行日志、报警日志是否能正常导出。
激光灯源启动后是否正常稳定;
查看检测通道(FAM、VIC、NED、PET、LIZ等)是否可被识别;
进行一次无样本运行,确认激发系统无光路偏差。
使用推荐的测试标准,如Thermo Fisher提供的定量DNA Ladder或多重PCR产物;
准备标准样本,进行实际电泳运行;
检查毛细管分离能力是否良好,片段峰形是否清晰、对称;
判断峰位对应的片段长度是否与理论标准一致,偏差应在±1bp范围内。
启动聚合物加载程序,检测聚合物是否顺利注入毛细管;
检查聚合物流速、压力是否稳定,避免出现聚合物残留或气泡阻塞;
对比聚合物粘度设定值与实际运行表现,确保参数一致。
设置不同的进样电压(1.2–1.6 kV)和时间(10–20秒)进行测试;
检测是否存在因进样不均造成的峰形异常;
调整进样时间可评估系统灵敏度与重复性。
选择1~3个已知STR类型的样本,每个样本平行分装为3份;
采用完全相同的反应体系和电泳设置进行分析;
比较每次运行所得电泳图谱中各条峰的位置、峰高、峰面积;
峰位偏差控制在±0.5bp以内,峰高CV值不高于15%,否则需检查系统稳定性。
使用微卫星或多重PCR产物,测试200–400 bp范围的片段;
在峰间距为1~2 bp时是否能完全区分不同片段;
评估仪器在复杂样本背景下的分辨性能。
ROX 500或600标准品作为片段校准基准;
比对每一运行中标准峰的实际大小与预设值;
偏差应不超过±0.3 bp,大小标准的校准拟合曲线应平滑、连续。
取梯度稀释的DNA模板(例如10 ng、1 ng、0.1 ng、0.05 ng)进行PCR;
每种浓度电泳测试,观察峰值高度、是否出现丢峰现象;
记录最低检测浓度下仍能识别所有片段的灵敏度;
正常仪器灵敏度应达到0.05~0.1 ng/μL。
使用多重荧光标记PCR产物,如DS-33染料集;
检查FAM、VIC、NED、PET等通道信号是否均衡;
若某一通道信号显著偏低,应检查光学系统清洁情况或激光路径校准。
准备PCR空白反应液(不含DNA模板),上样电泳;
检查是否出现无源背景峰或污染峰;
空白样本中如出现明显荧光信号,应怀疑系统存在交叉污染或聚合物残留。
在两个不同STR谱型样本之间插入纯水或空白孔;
如在空白孔中检测到与相邻样本一致的峰值,则说明存在拖尾污染;
建议更换进样针或清洗样本加载模块。
软件中观察未上样孔的基线图谱;
背景应低于100 RFU,如超过此值,考虑光路干扰或缓冲液污染。
安排样本在不同时间段、连续运行12小时以上;
记录每次运行的峰位、峰高、进样状态、电压波动等参数;
观察是否出现信号衰减、毛细管堵塞或聚合物流动异常等现象。
记录POP-7在多次运行后信号一致性变化;
分析是否随着使用次数增加出现聚合物降解现象;
设定聚合物有效使用周期(如100次或14天)并进行更换提示验证。
启动GeneMapper或GeneMarker软件,导入.fsa原始文件;
测试软件的自动峰识别、校准、片段命名功能;
检查结果图谱、峰面积计算是否准确;
检查结果输出格式(Excel、PDF等)是否支持实验室数据标准;
测试是否能将分析结果上传至实验室信息管理系统(LIMS);
验证分析模板是否能定制以适配不同实验需求。
设备到货后,厂家通常提供一套验收测试项目。以下是推荐验收测试核心指标:
测试项目 | 评估指标 | 合格标准 |
---|---|---|
毛细管通道检查 | 所有通道信号正常,无堵塞 | 8通道/24通道均可工作 |
信号强度 | 所有荧光通道均能检测到标准信号 | 信号峰值 ≥1500 RFU |
大小标准校准精度 | 每个峰定位与标准差距 ≤0.3 bp | R² > 0.99 拟合优良 |
片段分辨能力 | 2 bp 间距能清晰区分 | 峰形不拖尾、无叠加 |
样本一致性 | 重复样本CV值 ≤15% | 峰位差 ≤0.5 bp |
空白污染检查 | 空白孔无有效信号 | 全部背景 <100 RFU |
问题现象 | 可能原因 | 解决方案 |
---|---|---|
电泳信号消失或很低 | 样本降解、毛细管堵塞、聚合物干涸 | 更换样本、冲洗阵列、更换聚合物 |
信号过强峰顶截断 | 上样浓度过高、进样时间过长 | 稀释PCR产物、缩短进样时间 |
ROX标准峰漂移 | 热变性不足、模板变性不彻底 | 重新热变性处理样本 |
进样顺序错乱 | 样本板未校准、软件设置错误 | 重新加载样本板并核对样本表 |
软件不识别激光系统 | 激光未启动或线路故障 | 检查连接、联系厂家技术人员支持 |
赛默飞3500基因分析仪是一台性能优异的DNA分型设备,其工作稳定性和分析能力依赖于规范的测试和调试流程。通过全面的设备测试,包括性能验证、样本一致性、污染控制、信号灵敏度与数据精度检测,能够有效确保仪器长期高效运行,为后续的实验分析提供可靠保障。
建议每间实验室在设备正式投入使用前完成一次完整的设备性能评估,并建立周期性测试与维护档案,以确保系统始终处于最优工作状态。
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